• Melahirkan murid-murid yang menhayato dan mengamalkan ajaran Islam sebenar dalam kehidupan.
• Melahirkan GPI yang kreatif da inovatif dalam pengurusan pengajaran dan pembelajaran.

• Meningkatkan Kualiti Pendidkan Islam yang berkesan untuk melahirkan murid yang berilmu, beriman, dan berakhlak mulia bagi membangunkan masyarakat dan negara.
• Meningkatkan kualiti Bahasa Arab  ayng berkesan untuk membolehkan murid berkomunikasi dengan baik dan mendalami pelbagai sumber ilmu
• Meningkat kualiti pengurusan penempatan dan pertukaran Guru-Guru Pendidikan Islam dengan cekap dan strategik supaya perkhidmatannya dapat menyumbang ke arah keberkesanan Pendidikan Islam
• Meningkatkan kemahiran dan ketrampilan Guru Pendidikan Islam dalam Bahasa Arab secara berterusan dalam pelbagai bidang supaya pengajaran dan pembelajarannya sentiasa menarik dan berkesan.

Fungsi 1 : Pengurusan Pendidikan Islam

 a) Menyelaras, mengurus dan menilai pelaksanaan Operasi Pendidikan Islam dan Bahasa Arab serta segala keperluan yang berkaitan dengannya:

•  Menyelaras, mengurus, dan menilai serta mengawal pengoperasian dan mensyuarat-mesyuarat utama yang berkaitan dengan pelaksanaan Pendidikan Islam dan Bahasa Arab
• Menyelaras dan mengurus maklum balas berhubung pelaksanaan operasi dan mesyuarat-mesyuarat yang berkaitan dengan pelaksanaan operasi Pendidikan Islam dan Bahasa Arab
  
• Menyelaras dan mengurus hal ehwal keperluan Guru Pendidikan Islam dan Bahasa Arab di Institusi Pendidikan
• Menyelaras dan mengurus serta menilai peningkatan kualiti program-program SPI dan kualiti pelaksanaan Operasi Pendidikan Islam dan Bahasa Arab
• Mengumpul, menganalisis dan mengurus data dan maklumat personal, IPA JPN dan program yang berkaitan dengan pelaksanaan Operasi Pendidikan Islam dan Bahasa Arab

 b) Menyelaras, mengurus dan mengawal selia pengurusan sumber manusia, pengurusan kewangan dan pentadbiran serta tadbir urus ICT SPI dan IPA

• Menyelaras dan mengurus hal ehwal pengurusan dan pentadbiran SPI.
• Menyelaras dan mengurus hal ehwal perkhidmatan personal di SPI dan IPA.
• Menyelaras dan mengurus hal ehwal kewangan dan akaun SPI dan IPA.
• Menyelaras dan mengurus sistem aplikasi ICT/portal.

Fungsi 2 : Pengurusan Institut Pendidikan Agama

 a) Menyelaras dan mengurus keperluan serta pengoperasian IPA JPN dari aspek pentadbiran sekolah, pengurusan guru, dan murid serta penyelarasan Kelas Aliran Agama (KAA)

• Menyelaras, mengurus, dan menilai urusan pentdbiran IPA dan pelaksanaan operasi yang berkaitan dengannya
• Menyelaras, mengurus, dan menilai pelaksanaan urusan kurikulum agama di IPA
• Menyelaras, mengurus, dan menilai pelaksanaan urusan hal ehwal murid, sukan dan kokurikulum di IPA
• Menyelaras, mengurus, dan menilai pelaksanaan urusan hal ehwal Guru IPA
• Menyelaras, mengurus, dan menilai pelaksanaan urusan KAA
  

 b) Menyelaras dan mengurus institusi bagi pelaksanaan program pembangunan Pendidkan Islam dan Bahasa Arab dalam aspek penyelidikan dan pendokumentasian

• Menyelaras, mengurus, dan menilai aktiviti penyelidikan terhadap pelaksanaan Pendidikan Islam dan Bahasa Arab serta menilai pencapaiannya di pelbagai peringkat bawah JPN
• Mengurus dan menilai aktiviti penjanaan idea, penataran dan penyebarluasan dapatan kajian mengenai Pendidikan Islam dan Bahasa Arab melalui kursus, seminar, konvensyen dan bengkel
  

 c) Menyelaras, mengurus, dan menilai bantuan perolehan, penyediaan perkhidmatan dan pembangunan IPA JPN dan bantuan SAR KAFA serta Institusi Pendidikan yang melaksanakan program Pendidikan Islam.

• Menyelaras, mengurus, dan menilai urusan bantuan perolehan dan penyediaan di IPA JPN dan institusi pendidikan yang melaksanakan program Pendidikan Islam
• Menyelaras, mengurus, dan menilai bantuan pembangunan fizikal IPA dan Institusi Pendidikan yang melaksanakan program Pendidikan Islam
• Menyelaras, mengurus, dan menilai bantuan kewangan kepada SAR yang melaksanakan kurikulum KAFA
  

Fungsi 3 : Operasi Dakwah

 a) Menyelaras, mengurus, dan menilai pelaksanaan dasar dan operasi program dakwah dan kepimpinan untuk Murid, Guru,Pegawai dan Kakitangan JPN

• Menyelaras, mengawal, mengurus dan menilai program dakwah Islamiah dan operasi Majlis Kegiatan Dakwah Islamiah Sekolah-Sekolah Malaysia (MAKDIS)
• Menyelaras, mengawal, mengurus dan menilai program kepimpinan Islam
• Menyelaras, mengawal, mengurus dan menilai program kawalan akidah dan pemikiran Islam

 b) Menyelaras, mengawal, mengurus dan menilai pelaksanaan program pengembangan syiar islam dan pengukuhan budaya Islam kepada Murid, Guru, Pegawai Kakitangan JPN

• Menyelaras,mengawal, mengurus dan menilai program pembangunan akhlak dan pengembangan syiar Islam.
• Menyelaras , mengawal, mengurus dan menilai program pengukuhan budaya dan nilai Islam.